Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGSM2O43147 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGSM2O43147 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms