Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NUPL2O15504 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUPL2O15504 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms