Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP290O15078 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP290O15078 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP290O15078 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP290O15078 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP290O15078 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP290O15078 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP290O15078 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP290O15078 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP290O15078 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP290O15078 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP290O15078 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP290O15078 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP290O15078 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP290O15078 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP290O15078 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP290O15078 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP290O15078 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP290O15078 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP290O15078 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP290O15078 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP290O15078 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP290O15078 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP290O15078 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP290O15078 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP290O15078 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP290O15078 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP290O15078 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP290O15078 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP290O15078 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP290O15078 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP290O15078 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP290O15078 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP290O15078 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP290O15078 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP290O15078 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP290O15078 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP290O15078 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP290O15078 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP290O15078 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP290O15078 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP290O15078 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP290O15078 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP290O15078 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP290O15078 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP290O15078 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEP290O15078 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEP290O15078 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEP290O15078 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CEP290O15078 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEP290O15078 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP290O15078 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP290O15078 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP290O15078 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP290O15078 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP290O15078 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP290O15078 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP290O15078 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP290O15078 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP290O15078 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP290O15078 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP290O15078 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP290O15078 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP290O15078 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP290O15078 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP290O15078 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP290O15078 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP290O15078 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP290O15078 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP290O15078 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP290O15078 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP290O15078 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP290O15078 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP290O15078 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP290O15078 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP290O15078 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP290O15078 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP290O15078 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP290O15078 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP290O15078 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP290O15078 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP290O15078 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP290O15078 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP290O15078 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP290O15078 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP290O15078 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP290O15078 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP290O15078 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP290O15078 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP290O15078 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP290O15078 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP290O15078 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP290O15078 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP290O15078 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP290O15078 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP290O15078 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP290O15078 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP290O15078 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP290O15078 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP290O15078 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
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