Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPN9O14815 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN9O14815 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms