Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRDMT1O14717 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDMT1O14717 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms