Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAFD1O14545 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
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