Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 FKBP9-213ENST00000494374 1549 ntTSL 519.56■□□□□ 0.722e-15■■■■■ 38.3
DDX3XO00571 FKBP9-204ENST00000464334 541 ntTSL 517.71■□□□□ 0.432e-15■■■■■ 38.3
DDX3XO00571 FKBP9-206ENST00000469202 711 ntTSL 416.29■□□□□ 0.22e-15■■■■■ 38.3
DDX3XO00571 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.22e-15■■■■■ 38.3
DDX3XO00571 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.082e-15■■■■■ 38.3
DDX3XO00571 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.294e-12■■■■■ 38.3
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DDX3XO00571 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.872e-21■■■■■ 38.3
DDX3XO00571 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.133e-10■■■■■ 38.2
DDX3XO00571 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.033e-10■■■■■ 38.2
DDX3XO00571 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 38.2
DDX3XO00571 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 38.2
DDX3XO00571 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 38.2
DDX3XO00571 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 38.2
DDX3XO00571 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 38.2
DDX3XO00571 ELP5-209ENST00000573513 827 ntTSL 514.88□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 38.2
DDX3XO00571 ELP5-206ENST00000570500 473 ntTSL 214.88□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 38.2
DDX3XO00571 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 38.2
DDX3XO00571 ELP5-210ENST00000573657 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 38.2
DDX3XO00571 GPR160-204ENST00000478364 477 ntTSL 315.39■□□□□ 0.059e-14■■■■■ 38.2
DDX3XO00571 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.885e-7■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.55e-7■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 SLC43A2-209ENST00000575944 489 ntTSL 216.3■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 VPS35-207ENST00000568191 520 ntTSL 44.55□□□□□ -1.684e-9■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.194e-9■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.221e-6■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 RAP2C-203ENST00000460462 804 ntTSL 312.69□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 RAP2C-205ENST00000620646 3341 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.484e-7■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.052e-13■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 TUBG1-205ENST00000591509 847 ntTSL 319.29■□□□□ 0.682e-13■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 TUBG1-202ENST00000588056 574 ntTSL 219.29■□□□□ 0.682e-13■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 TUBG1-204ENST00000589688 1505 ntTSL 514.19□□□□□ -0.142e-13■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 TUBG1-203ENST00000589613 916 ntTSL 1 (best)10.35□□□□□ -0.752e-13■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 B2M-202ENST00000544417 933 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.666e-44■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 B2M-208ENST00000559916 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.666e-44■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 B2M-204ENST00000558401 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.716e-44■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 B2M-212ENST00000561424 604 ntTSL 39.1□□□□□ -0.956e-44■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 B2M-206ENST00000559720 1220 ntTSL 58.87□□□□□ -0.996e-44■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 B2M-203ENST00000557901 407 ntTSL 1 (best)8.14□□□□□ -1.116e-44■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 B2M-201ENST00000349264 732 ntTSL 36.71□□□□□ -1.346e-44■■■■■ 38.1
DDX3XO00571 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.54e-21■■■■■ 38
DDX3XO00571 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.854e-9■■■■■ 38
DDX3XO00571 SLC25A32-205ENST00000523866 1347 ntTSL 220.17■□□□□ 0.827e-7■■■■■ 38
DDX3XO00571 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.37e-7■■■■■ 38
DDX3XO00571 SLC25A32-203ENST00000523256 2711 ntTSL 516.84■□□□□ 0.297e-7■■■■■ 38
DDX3XO00571 SLC25A32-202ENST00000521645 2815 ntTSL 516.48■□□□□ 0.237e-7■■■■■ 38
DDX3XO00571 GAA-208ENST00000574376 952 ntTSL 1 (best)15.24■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 38
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DDX3XO00571 KIAA0100-205ENST00000577417 1839 ntTSL 1 (best)16.93■□□□□ 0.35e-14■■■■■ 38
DDX3XO00571 KIAA0100-210ENST00000580882 1582 ntTSL 1 (best)15.88■□□□□ 0.135e-14■■■■■ 38
DDX3XO00571 KIAA0100-202ENST00000528896 7407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.85e-14■■■■■ 38
DDX3XO00571 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.115e-14■■■■■ 38
DDX3XO00571 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.135e-14■■■■■ 38
DDX3XO00571 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 37.9
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DDX3XO00571 MAN2A2-223ENST00000560534 361 ntTSL 516.2■□□□□ 0.187e-10■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 MAN2A2-210ENST00000558853 624 ntTSL 315.35■□□□□ 0.057e-10■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 MAN2A2-218ENST00000559999 529 ntTSL 414.49□□□□□ -0.097e-10■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 MANF-202ENST00000470900 1509 ntTSL 226.83■■□□□ 1.893e-12■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 NNT-202ENST00000344920 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.313e-12■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 NNT-208ENST00000512996 4288 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.853e-12■■■■■ 37.9
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DDX3XO00571 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.163e-12■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 NNT-207ENST00000512422 754 ntTSL 36.18□□□□□ -1.423e-12■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.256e-14■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.096e-14■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.679e-12■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.146e-8■■■■■ 37.9
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DDX3XO00571 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.035e-11■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 DDR1-244ENST00000482873 2673 ntTSL 516.47■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.125e-7■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.225e-7■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 DDR1-223ENST00000324771 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.45e-7■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 DDR1-227ENST00000376570 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.45e-7■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 DDR1-232ENST00000418800 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.45e-7■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 DDR1-239ENST00000452441 3857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.495e-7■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 DDR1-240ENST00000454612 3942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.495e-7■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.583e-9■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 MRPS5-205ENST00000475040 713 ntTSL 29.69□□□□□ -0.863e-9■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 DNAJC1-204ENST00000476103 682 ntTSL 218.19■□□□□ 0.52e-8■■■■■ 37.9
DDX3XO00571 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.71e-7■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 OTULIN-204ENST00000507335 742 ntTSL 226.49■■□□□ 1.838e-9■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 OTULIN-202ENST00000503023 911 ntTSL 520.68■□□□□ 0.98e-9■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.048e-9■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.442e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 KIAA1522-205ENST00000468130 684 ntTSL 226.93■■□□□ 1.91e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.792e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.741e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SDR39U1-221ENST00000556707 1196 ntTSL 225.53■■□□□ 1.682e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 SDR39U1-209ENST00000554947 1203 ntTSL 225.18■■□□□ 1.622e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.432e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.382e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.372e-10■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.32e-8■■■■■ 37.8
DDX3XO00571 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.272e-8■■■■■ 37.8
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