Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3CDO00329 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3CDO00329 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms