Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCER2I3L3R5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCER2I3L3R5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms