Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E9PMD0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E9PMD0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E9PMD0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E9PMD0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E9PMD0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E9PMD0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E9PMD0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E9PMD0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E9PMD0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E9PMD0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E9PMD0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E9PMD0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E9PMD0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E9PMD0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E9PMD0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E9PMD0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E9PMD0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PMD0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PMD0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PMD0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PMD0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PMD0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PMD0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PMD0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PMD0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PMD0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PMD0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PMD0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PMD0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PMD0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PMD0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PMD0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
E9PMD0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
E9PMD0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
E9PMD0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
E9PMD0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
E9PMD0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E9PMD0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E9PMD0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E9PMD0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E9PMD0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E9PMD0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E9PMD0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E9PMD0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E9PMD0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E9PMD0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PMD0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PMD0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PMD0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PMD0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PMD0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PMD0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PMD0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PMD0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PMD0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PMD0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PMD0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PMD0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PMD0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PMD0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PMD0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PMD0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PMD0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PMD0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PMD0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E9PMD0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PMD0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PMD0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PMD0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PMD0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PMD0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PMD0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PMD0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PMD0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PMD0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PMD0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PMD0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PMD0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PMD0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PMD0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PMD0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PMD0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PMD0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PMD0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E9PMD0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E9PMD0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E9PMD0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E9PMD0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E9PMD0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E9PMD0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E9PMD0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E9PMD0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E9PMD0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E9PMD0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E9PMD0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E9PMD0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E9PMD0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E9PMD0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E9PMD0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms