Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MCRIP1C9JLW8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms