Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOBPA7XYQ1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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