Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC69A6NI79 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC69A6NI79 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms