Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CFAP73A6NFT4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms