Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZNF316A6NFI3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms