Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNDIG1LA6NDD5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYNDIG1LA6NDD5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms