Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMB4A4D0S4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMB4A4D0S4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms