Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMD3A2A2Y4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms