Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCE3A1L190 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCE3A1L190 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCE3A1L190 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms