Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.33■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
UBA6A0AVT1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms