Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F8A0AVK6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F8A0AVK6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms