Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1E9

TRBV7-7, T-cell receptor beta variable 7-7 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-7A0A0K0K1E9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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