Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPS6KL1Q9Y6S9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPS6KL1Q9Y6S9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms