Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX9Q9Y5X1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX9Q9Y5X1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms