Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF330Q9Y3S2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF330Q9Y3S2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF330Q9Y3S2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms