Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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HCN4Q9Y3Q4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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HCN4Q9Y3Q4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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HCN4Q9Y3Q4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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HCN4Q9Y3Q4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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HCN4Q9Y3Q4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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HCN4Q9Y3Q4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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HCN4Q9Y3Q4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HCN4Q9Y3Q4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN4Q9Y3Q4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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