Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms