Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YBX2Q9Y2T7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
YBX2Q9Y2T7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YBX2Q9Y2T7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms