Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNEQ9Y223 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GNEQ9Y223 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNEQ9Y223 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms