Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHOC2Q9UQ13 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHOC2Q9UQ13 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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