Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC12A4Q9UP95 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A4Q9UP95 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms