Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHA4Q9UN74 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHA4Q9UN74 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHA4Q9UN74 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHA4Q9UN74 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHA4Q9UN74 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHA4Q9UN74 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHA4Q9UN74 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHA4Q9UN74 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA4Q9UN74 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA4Q9UN74 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA4Q9UN74 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA4Q9UN74 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA4Q9UN74 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA4Q9UN74 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA4Q9UN74 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA4Q9UN74 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA4Q9UN74 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA4Q9UN74 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHA4Q9UN74 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHA4Q9UN74 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms