Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

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Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRQQ9UMZ3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRQQ9UMZ3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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