Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN11Q9UMQ6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN11Q9UMQ6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN11Q9UMQ6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN11Q9UMQ6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN11Q9UMQ6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN11Q9UMQ6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN11Q9UMQ6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN11Q9UMQ6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN11Q9UMQ6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN11Q9UMQ6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN11Q9UMQ6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms