Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPRSS11EQ9UL52 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMPRSS11EQ9UL52 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms