Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA11Q9UKX5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms