Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms