Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN16Q9UKR8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN16Q9UKR8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms