Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF3C4Q9UKN8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms