Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms