Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VAX2Q9UIW0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms