Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHORDC1Q9UHD1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHORDC1Q9UHD1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms