Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
IFT172Q9UG01 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
IFT172Q9UG01 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
IFT172Q9UG01 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
IFT172Q9UG01 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
IFT172Q9UG01 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
IFT172Q9UG01 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
IFT172Q9UG01 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms