Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
APEX2Q9UBZ4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APEX2Q9UBZ4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms