Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLN8Q9UBY8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN8Q9UBY8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms