Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL9Q9P2J3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL9Q9P2J3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL9Q9P2J3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL9Q9P2J3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL9Q9P2J3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL9Q9P2J3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL9Q9P2J3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL9Q9P2J3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL9Q9P2J3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL9Q9P2J3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL9Q9P2J3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL9Q9P2J3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL9Q9P2J3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL9Q9P2J3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLHL9Q9P2J3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLHL9Q9P2J3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLHL9Q9P2J3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLHL9Q9P2J3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms