Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCMF1Q9P0J7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms