Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRN3Q9NYV6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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