Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms