Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAH9Q9NYC9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms